STIMIK Kupang menyelenggarakan Program Studi Teknik Informatika dengan tujuan untuk menghasilkan lulusan Sarjana Komputer di bidang Sistem Teknik Informatika yang mampu menggabungkan kemajuan teknologi informasi dan komunikasi dalam upaya pencapaian tujuan tertentu, juga memiliki kemampauan membangun sistem informasi berbasis web, mobile dan desktop, memiliki penguasaan database, security, dan network